两个有家庭的人出轨并有了孩子，这是一个涉及伦理、道德和法律的问题。针对这种情况，可以从以下几个方面进行处理：

一、处理婚姻关系

协议离婚：双方可以选择协议离婚，通过协商达成离婚协议，包括财产分割、子女抚养等问题。如果双方能够就离婚事宜达成一致，可以向婚姻登记机关申请离婚登记。

诉讼离婚：如果一方不同意离婚或者双方在财产、子女抚养等问题上存在分歧，另一方可以向人民法院提起离婚诉讼。根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条，人民法院会进行调解，如果调解无效且感情确已破裂，法院会准予离婚。

二、处理非婚生子女问题

非婚生子女享有与婚生子女同等的权利，任何组织或者个人不得加以危害和歧视。不直接抚养非婚生子女的生父或者生母，应当负担未成年子女或者不能独立生活的成年子女的抚养费。

确定抚养权：双方可以协商确定非婚生子女的抚养权，如果协商不成，可以根据《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条的规定，向法院申请判决。法院会根据双方的具体情况和最有利于未成年子女的原则来判决抚养权。

抚养费问题：不直接抚养非婚生子女的生父或生母，应当负担未成年子女或者不能独立生活的成年子女的抚养费。抚养费的数额可以根据子女的实际需要、父母的负担能力和当地的实际生活水平来确定。

三、法律责任与损害赔偿

出轨行为虽然不直接构成犯罪，但可能会对婚姻关系造成破裂，导致离婚。在离婚诉讼中，无过错方有权请求损害赔偿。根据《中华人民共和国民法典》第一千零九十一条的规定，重婚或与他人同居等情形导致离婚的，无过错方有权请求损害赔偿。

综上所述，两个有家庭的人出轨并有了孩子，需要妥善处理婚姻关系和非婚生子女问题。在处理过程中，应当遵循法律法规的规定，尊重彼此的权益，以和平、理性的方式解决问题。