小三怀孕了，法律上主要会从以下几个方面进行处理：

一、对于婚姻关系的处理

1. 若婚姻关系中的一方（通常是男方）与小三发生关系并导致小三怀孕，这可以视为重婚或者与他人同居的情形。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，若当事人起诉要求离婚，人民法院经调解无效，应当准予离婚。

2. 在离婚案件中，若存在重婚或者与他人同居的情形，无过错方有权请求损害赔偿。这意味着，因小三怀孕导致离婚的情况下，无过错方（通常是女方）可以要求对方进行经济赔偿。

二、对于财产分割的处理

在因小三怀孕导致的离婚案件中，若当事人请求分割共同财产的，人民法院应当根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方利益的原则判决。这意味着，在财产分割过程中，法院会倾向于保护无过错方和子女的权益。

三、对于孩子抚养权的处理

1. 小三怀孕所生的孩子，虽然其出生背景可能较为复杂，但法律上仍然享有与婚生子女同等的权利。任何组织或者个人不得对其进行危害和歧视。

2. 对于孩子的抚养权问题，首先应由双方协商确定。协商不成的，可以根据孩子的年龄和具体情况进行判断。一般来说，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，若父母双方对抚养问题协议不成，则由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。

综上所述，小三怀孕了法律上会从婚姻关系、财产分割以及孩子抚养权等方面进行处理。在处理过程中，法院会倾向于保护无过错方和子女的权益，并根据具体情况进行公正合理的判决。