早恋被学校停课是否合法，需结合具体情况进行分析。

早恋本身并不违法。早恋属于青春期正常的生理现象，我国法律对于早恋并无明文规定，根据法律“法无明文禁止不为罪”的原则，“早恋”不属于违法行为。

学校对学生停课需遵循相关规定。如果学生确实违反了学校某项规定，且该规定中明确包含了停课作为处罚措施，那么学校按照规定对学生进行停课处理是合法的。然而，如果学校没有此类明确规定，或者停课处理超出了学校规定的范围，那么学校的停课决定可能构成违规。

保障学生的受教育权。根据《中华人民共和国义务教育法》第四条和第五条的规定，适龄儿童、少年依法享有平等接受义务教育的权利，并履行接受义务教育的义务。学校应当保障学生的受教育权，不得随意剥夺。因此，即使学生存在早恋行为，学校也应通过合理的方式进行教育和引导，而非直接采取停课等严厉措施。

综上所述，早恋被学校停课是否合法需视具体情况而定。如果学校的停课决定违反了相关法律法规或学校规定，学生和家长有权向教育行政管理部门反映情况并寻求合法救济。